Комиссия проводила опрос свидетелей, составляла списки сожженных, расстрелянных, повешенных, угнанных на принудительные работы в Германию людей вплоть до завершения своей работы в сентябре 1945 года.
15 декабря 1945 года областная ЧГК подвела итоги своей работы. По ее данным общий ущерб, причиненный хозяйству области в денежном выражении, составил 36.503.687.000 рублей, в том числе колхозам – более 5 миллиардов рублей, государственным предприятиям и учреждениям – 12,2 миллиарда рублей, гражданам – 19,1 миллиарда рублей. За время оккупации гитлеровцы и их союзники сожгли 72676 строений в колхозах, 7585 строений у государственных предприятий и учреждений культуры, 92805 жилых домов у граждан.
Собранные комиссией материалы следствия использовались в ходе открытого судебного процесса над фашистскими преступниками в Новгороде с 7 по 17 декабря 1947 года.
Согласно обвинительному заключению Главного военного прокурора Верховного Суда СССР по делу участников зверств и злодеяний на территории Новгородской области, в Новгородской области немецкие захватчики и их сообщники уничтожили и разрушили 7656 строений, в том числе 2695 жилых домов, 288 промышленных предприятий, 11 электростанций, 173 лечебных учреждения, 198 театров, клубов, красных уголков, 120 церквей, 89 магазинов. Общий размер ущерба по данным на 1947 год составил 24.855.207.000 рублей.