Злодеяния делятся на общие категории (разделы), в целом синхронизированные с системой обвинений, использованной на Нюрнбергском и Токийском процессах и на советских процессах 1943-1949 гг.

Некоторые виды злодеяний выделены из определённых на Нюрнбергском процессе категорий преступлений, например «Истребление народов» относится к преступлениям против человечности («преследования по политическим, расовым или религиозным мотивам»); а злодеяния «Против населения» попадают и в категорию военных преступлений («убийства, истязания или увод в рабство или для других целей гражданского населения оккупированной территории»), и преступлений против человечности («убийства, истребление, порабощение, ссылка и другие жестокости, совершенные в отношении гражданского населения до или во время войны»).

Против населения

Злодеяния против мирного населения во время Второй мировой войны, осуществлявшиеся вооружёнными силами, спецслужбами и особыми формированиями Германии и Японии, их союзников и пособников.

Против человечности

Злодеяния разного вида — военные преступления против определённых групп населения, в первую очередь — реализация айнзатцгруппами и немецкими пособниками программы эвтаназии на оккупированной территории СССР.

Против военнопленных

Злодеяния против военнопленных во время Второй мировой войны, совершавшиеся Германией и Японией, их союзниками и пособниками, как в местах изоляции, так и непосредственно после боевых действий.

Против мира

Рассматриваются вопросы подготовки и развязывании агрессивной войны Германией, Италией, Японией против ряда европейских и азиатских государств, начиная от агрессии Японии против Китая в 1937 году.

Места изоляции

Рассматриваются злодеяния, совершённые в концлагерях разных типов и разной функциональности, от транзитных лагерей для военнопленных до лагерей уничтожения; гетто; тюрьмах, используемые также как места казней.

Пособники оккупантов

Злодеяния пособников Германии, Японии и их союзников, включая действия военных и военизированных формирований на оккупированных территориях, создание и деятельность политических организаций в угоду оккупантам.

Разрушение

Разрушение и уничтожение населённых пунктов, объектов промышленности, транспорта и связи, культурных ценностей; разорение социально-экономического пространства, не оправданное военной необходимостью.

Разграбление

Разграбление государственной, общественной и частной собственности, культурных и научных ценностей; изъятие и вывоз в Германию культурных ценностей с оккупированных территорий.

Рабский труд

Угон миллионов людей с оккупированных территорий на принудительный труд в Германию; принуждение военнопленных к рабскому труду; использование людей на тяжелых работах по месту проживания, особенно на оккупированных территориях СССР.

Истребление народов

Истребление народов (геноцид) во время Второй Мировой войны осуществлялся странами Оси, их союзниками и пособниками в отношении различных народов. Также немцами и их пособниками осуществлялся стратоцид.